提高有效供給，化解過剩產能是供給側改革的重要核心。萬連步認為，推進化肥行業供給側改革應鼓勵企業綠色發展、智能制造，實現行業轉型升級。他說：“針對當前資源環境政策收緊，企業生產成本壓力過大的問題，建議相關部門通過設立專項資金、給予補貼等方式，推廣節能減排先進技術，設立專項資金，推進中低品位磷礦、難溶性鉀鹽等開發難度較高資源的綜合利用技術研發與應用，對磷石膏等綜合利用產品實行免征增值稅或即征即退的稅收優惠政策，持續推進行業兩化深度融合，提升化肥企業在資源配置、工藝優化、過程控制、產業鏈管理等方面的智能化水平。”他還建議，相關部門完善鼓勵產業協同發展的政策措施，支持復合肥、新型肥料等下游企業與上游單質肥企業進行上下游融合，建立以能耗、污染物排放、安全生產等指標為標尺的落后產能綜合評價、退出機制，細化相關處置方案，加快落后產能退出。 

　　在萬連步看來，鼓勵具有技術、品牌、資金等優勢的化肥企業加速“走出去”，是化肥行業供給側改革的一個重要手段。他表示：“統籌國際國內兩個市場，順應中央提出的‘一帶一路’戰略，也符合農業供給側結構性改革的要求。”他建議相關部門對在海外設立或合辦研發機構、在海外投資或并購的企業，給予相應的財政資助、稅收優惠等政策支持，加強我國化肥企業對外投資生產經營活動的鼓勵、扶持、保護和引導，開辟“綠色通道”實行“一站式”服務，簡化對外投資審批流程，實行境外投資貼息貸款、優惠利率等信貸支持，以及給予政府補貼等融資政策，加強企業投資決策的信息服務，推動我國化肥企業海外投資建廠；鼓勵國內具有互補優勢的企業“抱團出海”，共同參與國際產能合作、開拓海外市場，培育具有國際競爭力的大企業大集團；完善我國化肥產品出口的相關政策，拉動我國化肥出口，化解產能過剩矛盾。 

　　此外，涉及農業發展根本的土壤改良修復、提升耕地質量問題也是萬連步議案中的重要內容。從立法角度上，他建議，建立一系列保護耕地質量的法律法規，達到頂層設計、全面規劃、科學管理和強化保護耕地資源的目的，從改良土壤、培肥地力、保水保肥、控污修復等不同層面，全面提高我國耕地綜合生產能力。在政策層面上，他希望政府完善市場準入制度，鼓勵優勢企業積極參與土壤修復工程。他介紹說：“我國土壤修復行業的產值占環保產業總產值的比重僅為0.5%，而其中僅有7.1%的比重用于修復耕地。目前土壤修復參與模式單一，主要以政府招標采購企業土壤調理或土壤修復產品的形式進行。建議通過進一步完善標準技術體系，研究制定土壤污染修復相關產品標準、檢驗方法標準、安全評價和應用技術規范等，建立明確的土壤修復產品市場準入制度，為耕地生態環境保護與土壤調理劑企業的規范發展提供依據。完善現有產品招標模式，避免低價低質競爭，鼓勵有實力的企業進入土壤修復工程。”