磷是農作物生長發育必不可少的重要元素。在缺磷的土壤中適量施用磷肥，對提高農作物的產量和品質有很好的作用，但過量施用磷肥則有害無益。
  消耗作物貯存的糖分和能量
  施用磷肥過量，會使作物從土壤中吸收過多的磷素營養，促使其呼吸作用大大增強。例如水稻吸收了過量的磷素，會使無效分蘗增加，葉片縮短，提早抽穗與成熟，引起減產。
  誘發土壤缺鋅
  過量施用過磷酸鈣，土壤中大量形成難溶性的磷酸鋅鹽，使作物出現明顯缺鋅癥狀；過量使用鈣鎂磷等堿性磷肥后，會使土壤堿化，理化性狀逐漸變劣。玉米百化癥、水稻僵苗坐蔸等就是由于作物得磷失鋅的結果。同時，磷酸根例子還能抑制作物對硫、銅等微量元素的吸收。打破土壤養分平衡，導致作物發育不良。
  作物得磷是硅
  硅對許多作物的生長和高產具有十分積極作用。喜硅作物水稻，若不能從土壤中吸收到較多的硅素就會發生莖稈纖細，倒伏及抗病能力差等缺硅癥狀。
  作物得磷缺鉬
  土壤中的磷和鉬一般條件下十分“友好”，并能互相促進，彼此增效。但過多是用磷肥，常常發生“強磷”現象，有時還會造成兩敗俱傷，使作物對磷、鉬都無法吸收利用。
  土壤有害元素積累
  磷肥主要來源于磷礦石，磷礦石中含有鎘、鉛、佛等有害元素。據國外報道，是用磷肥會引起土壤中的鎘的增加，給人畜造成危害。尤其要警惕進口磷肥。
  磷肥施用量以多少為宜？一般來講，即使缺磷土壤，每畝也不能超過40公斤，以30-35公斤為宜。磷肥后效較長，每2-3年基施一次即可。